Во просторот од неколку недели, сите научивме многу за COVID-19 и вирусот што го предизвикува: SARS-CoV-2. Но, имаше и многу гласини. Додека се зголемува бројот на научни статии за овој вирус, сè уште има многу загриженост за неговото потекло.

Во кои животински видови се појавил вирусот?

Лилјак, панголин или друг див вид? Од каде доаѓаат? 

Во декември 2019 година, 27 од првите 41 хоспитализирани лица (66 проценти) поминале низ пазар лоциран во срцето на градот Вухан во провинцијата Хубеи.

Но, според студијата спроведена во болницата Вухан, првото лице идентификувано дека има корорнарна болест не било често на оваа локација.
Молекуларното датирање засновано врз гените секвенци САРС-КоВ-2 го означува неговото потекло во ноември. Ова го покренува прашањето за врските помеѓу оваа епидемија COVID-19 и животинскиот свет.

Кинеските истражувачи брзо го секвенцирале генот САРС-КоВ-2 и откриле дека тоа е РНК молекул со околу 30.000 бази што содржат 15 гени, вклучувајќи го и генот С кој кодира протеин пронајден на површината на вирусната мембрана. Компаративните анализи за гените покажале дека САРС-КоВ -2 припаѓа на групата бетакоронавирус и е многу блиску до САРС-КоВ, одговорна за акутната епидемија на пневмонија што се случи во ноември 2002 година во провинцијата Гуангдонг во Кина, а потоа се шири во 29 земји во 2003 година.

Во тоа време, регистрирани се 8.098 случаи, вклучувајќи и 774 смртни случаи. Лилјаците од родот Ринолоф се знае дека биле резервоар на овој вирус и дека малиот месојад, палмин Цивит, би можел да послужи како средно домаќин помеѓу лилјаците и човечките први случаи.
Оттогаш, откриени се многу бетакоронавируси, главно кај лилјаци, но и кај луѓето.

На пример, RaTG13, изолиран од лилјаци од Rhinolophus affinis од кинеската провинција Јунан, неодамна беше опишан како многу сличен на САРС-КоВ-2, со генски секвенци идентични на 96 проценти.
Овие резултати индицираат дека лилјаците, а особено видови од родот Ринолоф, формираат резервоар на вируси САРС-КоВ и САРС-КоВ-2.

Но, како да се дефинира резервоарот?

Резервоар е еден или повеќе животински видови кои не се чувствителни или барем не многу чувствителни на вирусот. Отсуството на симптоми на болест се објаснува со ефективноста на нивниот имунолошки систем, што им овозможува да се борат со размножувањето на вирусот.

На 7 февруари 2020 година дознавме дека вирусот поблизу до САРС-КоВ-2 е откриен во панголин. Со 99 проценти од натпреварите со геном, ова укажува на тоа дека ова животно е прилично резервоар на вируси, а не дека тие се лилјаци.

Сепак, една неодамнешна студија покажува дека геномот коронавирус изолиран од малезискиот панголин е помалку сличен на САРС-Ков-2, со само 90 проценти од геномскиот натпревар.

Ова би укажувало на тоа дека вирусот изолиран во панголин не е одговорен за епидемијата COVID-19 во моментов беснее.

Сепак, коронавирусот изолиран од панголин е сличен на 99% од специфичниот регион на протеинот S, што одговара на 74 аминокиселини вклучени во доменот за врзување на рецепторот ACE што му овозможува на вирусот да влезе и зарази човечки клетки.

Ова значи дека коронавирусот изолиран од панголин може да влезе во човечки клетки, додека оној што е изолиран од него не може.
Покрај тоа, овие геномски споредби сугерираат дека вирусот САРС-Цов-2 е резултат на рекомбинација меѓу два различни вируси, едниот близу до RaTG13 и другиот поблизу до вирусот панголин.

Со други зборови, станува збор за химера помеѓу две постојни вируси.

Овој механизам за рекомбинација веќе е опишан во коронавирусите, конкретно за да се објасни потеклото на САРС-КоВ. Важно е да се знае дека рекомбинацијата резултира во нов вирус кој потенцијално може да зарази нов вид домаќин.
За да се случи рекомбинација, две различни вируси мораат истовремено да го заразат истиот организам.
Две прашања остануваат неодговорени: во кој организам се случи оваа рекомбинација? И пред сè – под кои услови се случи оваа рекомбинација?